マイナンバーで全ての個人情報が紐付けされるのであれば、もっと安全性の部分を説明して保証してほしいい

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最終的に全ての個人情報をマイナンバーで紐付けするということは、マイナンバー１つでその人の住所、職業、氏名、年齢、家族構成、病歴から犯罪歴、免停や交通違反したか、税金収めてるか、出身地は何処で、何処の幼稚園入って何処学校行って今に至るかまでその人の人生ほぼ全て一発で丸わかりになると思います。

メンテナンスとかで管理者権限で入るエンジニアさんとかこういうの見ようと思えば見れないのでしょうか？

安全性の部分は非常に心配です。
１００%安全であることはもっと説明すべきだと思います。